Análisis de la diversidad genética de monilia [moniliophthora roreri (cif y par) evans et al.] mediante marcadores microsatélites en cuatro regiones del Perú
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Date
2018
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Abstract
La diversidad genética fue evaluada en 35 genotipos de M. roreri,
patógeno causante de la moniliasis, una de las enfermedades limitantes en las
plantaciones de cacao (Theobroma cacao), con el fin de obtener más información
sobre la diversidad de este patógeno en cuatro regiones del Perú. Se estableció
un protocolo de aislamiento a partir de mazorcas infectadas. Las muestras
colectadas fueron georreferenciadas. Se estableció una micoteca y las entradas
de esta colección fueron caracterizadas con variables morfológicas de color,
borde, textura y presencia de sectores, como criterios para reconocer M. roreri
en cultivo in vitro. Asimismo, se estandarizó un protocolo de extracción eficiente
y amplificación de los ADNs. Una de las muestras amplificadas con iniciadores
ITS se envió a Estados Unidos para su secuenciamiento y el resultado se
comparó en BLASTn resultando un 80% de identidad con la cepa CBS 138635
de Moniliophthora roreri Sequence ID gb |KU674835.1|, revelando su identidad
con M. roreri. La caracterización molecular se realizó a través de marcadores
microsatélites; los marcadores SSR17 y SSR5 detectaron dos alelos, los demás
marcadores solo detectaron un alelo, los cuales no fueron representativos para
M. roreri. El promedio de alelos por población, patrón de alelos y curva de
diversidad, así como el análisis de agrupamiento con tres clústeres formados a
0.9 de similitud indicaron baja variabilidad genética en las cuatro poblaciones
estudiadas, lo que confirma la hipótesis de que en el Perú hay una sola línea
clonal de M. roreri.
Description
Keywords
cacao, diversidad genética, Moniliophthora roreri, marcadores microsatélites