Estudio preliminar de la diversidad genética de mycena citricolor (berk y curt) sacc. agente causal de “ojo de gallo” en las zonas cafetaleras del perú mediante marcadores RAPDs
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Date
2017
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Abstract
Mycena citricolor (Berk. y Curt.) Sacc. “ojo de gallo” La segunda
enfermedad fúngica más importante que afecta al cultivo de café, patógeno
basidiomiceto que ataca a cualquier parte de la planta y que tiene un rango
amplio de hospederos. En este estudio, se utilizaron los marcadores
moleculares RAPD como método para estudiar la diversidad genética de 11
colectas de M. citricolor, provenientes de 5 regiones del Perú: San Martin,
Huánuco, Cerro de Pasco, Junín y Puno. El material genético fue colectado
directamente del campo y se trasladaron al laboratorio en microtubo estéril. Se
realizó la extracción de ADN con el protocolo modificado de LÓPEZ (2001), se
probaron 17 iniciadores, de los cuales los que mostraron bandas con mayor
nitidez y polimorfismo fueron: OPA 04, OPE 03, OPE 04, OPE 13, OPI 06 y
OPI 08. Con los cuales, se realizó un análisis de agrupamiento UPGMA,
comparando 3 coeficientes de similaridad (Simple Matching, Jaccard y DICE), y
obteniendo tres dendrograma que discriminan a 7 clústeres o grupos,
formándose dos grupos de duplicados con los genotipos de Hermilio Valdizan
(HRA1 y HRA2) y Villa Rica (CPV1, CPV2 y CPV3). Por otro lado, en el
dendrograma de Simple Matching se forma un clúster entre los genotipos de
San Martin y Puno, indicando que existiría un flujo genético entre los ojos de
gallo de estas regiones. Esto no sucede en los otros dendrograma, sino se
agrupan los genotipos de San Martin con los de Junín, lo cual tendría mayor
sentido por la cercanía. En conclusión, los RAPDs como marcadores
moleculares han probado ser una herramienta útil para estudiar la diversidad
genética de este patógeno del café y puede servir para determinar el flujo
genético entre las poblaciones de regiones cafetaleras.
Description
Keywords
Mycena citricolor, RAPD, café, diversidad genética, patógeno
